两个原因：

1、长江泥沙：上海是长江入海口，长江每年几亿吨泥沙堆积在上海附近，形成“拦门沙”，自然水深就比较浅了。中国沿海洋流从北向南，从上海开始向南沉积的越来越少，给宁波也带来了一些长江泥沙，但带到宁波的泥沙量比较小。

2、港口附近的潮汐强度：宁波北仑港外海是岛屿众多的舟山群岛。这些海岛跟宁波大陆岸线之间形成的海峡会明显加强潮汐水流强度，强烈的潮汐水流冲刷海峡海底，带走了北仑港到舟山之间的泥沙，就形成了北仑港的深水岸线。而上海外海是一望无际的东海，没有什么海峡水道加强潮汐水流强度，泥沙更容易沉积。

下面看两个区域的海图，能明显看出来海岛海峡对水深的影响，以及长江拦门沙问题。